XJIPC OpenIR  > 资源化学研究室
盐芥ICE1转录因子的克隆及生物信息学分析
其他题名cloning and bioinformatics analysis of a transcription factor ice1 from thellungiella halophila
轩春雷; 肖向文; 李晓波; 祝建波
2010
发表期刊生物技术通报
ISSN1002-5464
期号11页码:108-114
摘要

ICE1基因编码一个MYB类型的碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)转录因子,在冷胁迫条件下调节CBF基因的表达,能够提高植物抗寒性。利用盐芥5′EST序列和拟南芥ICE13′UTR保守序列设计引物,从盐芥基因组中克隆得到了1个2525bp的基因xhICE。生物信息学分析,表明该基因具有4个外显子,4个内含子,外显子/内含子边界符合经典的GT-AG规则。由此推导的cDNA包含一个1500bp的开放阅读框,编码500个氨基酸。与拟南芥ICE1相比,二者的内含子具有相同的类型和相对保守的位置,在核酸水平与氨基酸水平高度同源,并且具有相同的bHLH结构域。以上分析都表明,xhICE基因可能是盐芥ICE1基因,涉及抗寒相关的CBF转录调控途径。

关键词转录因子 表达序列标签 生物信息学 Ice1
DOI10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2010.11.013
收录类别CSCD
CSCD记录号CSCD:4069150
引用统计
被引频次:3[CSCD]   [CSCD记录]
文献类型期刊论文
条目标识符http://ir.xjipc.cas.cn/handle/365002/1751
专题资源化学研究室
作者单位石河子大学生命科学学院;中国科学院新疆理化技术研究所
推荐引用方式
GB/T 7714
轩春雷,肖向文,李晓波,等. 盐芥ICE1转录因子的克隆及生物信息学分析[J]. 生物技术通报,2010(11):108-114.
APA 轩春雷,肖向文,李晓波,&祝建波.(2010).盐芥ICE1转录因子的克隆及生物信息学分析.生物技术通报(11),108-114.
MLA 轩春雷,et al."盐芥ICE1转录因子的克隆及生物信息学分析".生物技术通报 .11(2010):108-114.
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