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题名: 棕色棉F3’H-羟化酶基因的克隆与生物信息学分析
其他题名: cloning and bioinformatics analysis of flavonoid 3'-hydroxylase gene ghf3'hin brown cotton (gossypium hirsutum l.) fibers
作者: 梁明炜; 刘海峰; 肖向文; 陆雪莹; 李艳红; 宋武; 鲁春芳; 李晓波
关键词: 类黄酮3’-羟化酶 ; 棕色棉 ; RACE ; 序列分析
刊名: 生物技术通报
发表日期: 2011
期: 11, 页:199-206
收录类别: CSCD
资助者: 中国科学院新疆理化技术研究所博士启动资金项目,中国科学院“西部之光”人才培养计划项目(RCPY200802);转基因生物新品种培育重大专项项目(2009ZX08005-027B)
摘要: 根据葡萄的类黄酮3'-羟化酶(F3'H)基因全长cDNA序列Blast所得棉花的EST序列设计引物,以开花后16 d(DPA16)的新彩棉5号(XC-5)纤维为材料,利用RACE和RT-PCR技术分离得到了2个类黄酮3'-羟化酶基因cDNA序列,此2个序列编码区完全相同,仅在3'UTR区存在片段长短的差异,推测可能是基因转录后加工方式不同所造成。克隆所获得的棉花F3'H基因编码区全长1 533 bp,编码510个氨基酸,氨基酸序列分析预测表明,该基因所编码蛋白含有一个跨膜结构域,是一种分泌蛋白,定位于内质网上,并含有一段与细胞色素P450功能区相匹配的保守功能域;序列比对结果表明,棉花F3'H基因与其他多个物种的F3'H基因在氨基酸序列上有较高的同源性;聚类分析结果表明,棉花F3'H蛋白与双子叶植物大豆的F3'H亲缘关系较为接近,而与单子叶植物高粱等作物则较远。
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内容类型: 期刊论文
URI标识: http://ir.xjipc.cas.cn/handle/365002/1468
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棕色棉F3_H_羟化酶基因的克隆与生物信息学分析.pdf(3272KB)期刊论文作者接受稿开放获取View 联系获取全文

作者单位: 中国科学院新疆理化技术研究所新疆植物资源化学重点实验室;中国彩棉(集团)股份有限公司

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梁明炜,刘海峰,肖向文,等. 棕色棉F3’H-羟化酶基因的克隆与生物信息学分析[J]. 生物技术通报,2011(11):199-206.
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